As válvulas-diafragma ou válvulas de membrana são compostas de três partes: corpo, diafragma e castelo. Embora apresentem elevada resistência à temperatura, essas válvulas não são indicadas para trabalhos em condições assépticas.

Entre as desvantagens apresentadas pelos agitadores magnéticos em reatores de fermentação inclui-se a abertura para a passagem do eixo do agitador, a qual pode se tornar uma porta de entrada de agentes contaminantes.

A técnica de imobilização de células vivas por meio de seu envolvimento em gel hidrofílico é empregada na fermentação alcoólica de carboidratos por leveduras e bactérias.

O crescimento de biomassa celular dentro do leito fixo de partículas imobilizadas por adsorção é uma dificuldade operacional em processos contínuos de longa duração.

A silanização de esferas de vidros e a posterior reação com glutaraldeído são utilizadas para a imobilização celular em suporte modificado, mediante o método de adsorção.

Poliacrilamida, poliestireno e poliuretano são polímeros sintéticos que podem ser empregados na produção de suportes para imobilização de células vivas.

Solubilização do suporte, padrão irregular de fluxo no interior do reator e envenenamento não alteram o desempenho dos reatores com enzimas imobilizadas.

O uso de biorreator do tipo air-lift não é adequado para processos que utilizam células com elevada sensibilidade ao cisalhamento, devido à movimentação cíclica do fluido causada por esse biorreator.

A fermentação alcoólica pode ser realizada por meio de biorreatores que operam com elevadas concentrações celulares (high cell density cultures), o que resulta em alta velocidade de conversão do substrato em produto.

Os reatores com lâminas de membranas planas e os reatores de fibra oca apresentam a desvantagem de não proporcionarem a separação entre os fluxos de nutrientes e os fluxos de produtos metabólicos.