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A estrutura adequada de um laboratório que trabalha com Mycobacterium tuberculosis deve ter um sistema de exaustão de ar independente, de modo que em caso de acidente com gerações de aerossóis fora da cabine de segurança biológica haja contenção adequada. A recomendação do MANUAL DE RECOMENDAÇÕES PARA O DIAGNÓSTICO LABORATORIAL DE TUBERCULOSE E MICOBACTÉRIAS NÃO TUBERCULOSAS DE INTERESSE EM SAÚDE PÚBLICA NO BRASIL é a instalação de exaustor, com capacidade de:
 

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Um dos indicadores de qualidade do laboratório de micobactérias é o índice de contaminação de culturas de amostras do trato respiratório, em meio sólido, submetidas a descontaminação. Esse índice de ser aferido e avaliado mensalmente, e deve ser de:
 

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Em função da posologia de dose única diária, frequentemente é solicitado ao laboratório avaliar a sensibilidade ao ertapenem para micobactérias de crescimento rápido. O médico solicitante deve ser informado de que:
 

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Segundo o documento M24 do CLSI algumas cepas M. abscessus necessitam de incubação por até 14 dias para que possa ser feita a leitura dos testes de sensibilidade. Nesses casos, em função da instabilidade de alguns antimicrobianos, deve ser incluída nota explicativa no laudo e devem ser interpretados e reportados apenas:
 

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Segundo as normas vigentes do Ministério da Saúde e da Agência Nacional de Vigilância Sanitária, os testes de sensibilidade a antimicrobianos no Brasil devem ser realizados seguindo as normas da versão brasileira do European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing, o BrCAST. Entretanto, ainda não foram definidos pelo BrCAST pontos de corte para os testes de sensibilidade para micobactérias de crescimento rápido, e para o complexo M. tuberculosis ainda não há pontos de corte para os fármacos de primeira e segunda linhas. Enquanto não há critérios definidos pelo BrCAST, os métodos e critérios utilizados no Brasil para os testes de sensibilidade de micobactérias têm sido aqueles preconizados pelo Clinical and Laboratory Standards Institute no documento M24. Para as micobactérias de crescimento rápido o teste deve ser realizado com:
 

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A correta identificação molecular das espécies de micobactérias de crescimento rápido é essencial para guiar a terapia antimicrobiana empírica, e serve como um controle de qualidade dos resultados dos testes de sensibilidade in vitro. A expressão de resistência indutiva à claritromicina é frequente em:
 

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A cepa de controle de qualidade a ser utilizada nos testes de sensibilidade do Complexo M. tuberculosis é:
 

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A identificação molecular de micobactérias é essencial para que se conheça a epidemiologia das diferentes espécies. Com a redução do custo do sequenciamento de DNA e aumento da disponibilidade de sequenciadores de DNA, a amplificação e sequenciamento parcial de genes de cópia única tem sido cada vez mais utilizada nos laboratórios de micobactérias. São utilizados mais frequentemente os seguintes alvos gênicos para essa finalidade:
 

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Segundo o MANUAL DE RECOMENDAÇÕES PARA O DIAGNÓSTICO LABORATORIAL DE TUBERCULOSE E MICOBACTÉRIAS NÃO TUBERCULOSAS DE INTERESSE EM SAÚDE PÚBLICA NO BRASIL, publicado pelo Ministério da Saúde em 2022, todos os laboratórios que manuseiam amostras para testes diagnósticos para tuberculose devem ter pronto kit para ser utilizado em caso de derrame de material biológico fora da cabine de segurança biológica. São itens obrigatórios nesse kit, EXCETO:
 

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O tratamento de amostras do trato respiratório para eliminação da microbiota normal e concentração de micobactérias é importante para aumentar a sensibilidade da cultura. Por outro lado, o efeito letal dos métodos de descontaminação deve ser minimizado e a concentração de micobactérias deve ser maximizada por centrifugação, sempre considerando a segurança do analista. Devem ser utilizados, portanto:
 

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