Se a fonte de luz utilizada para o microscópio for monocromática, ela emitirá radiação eletromagnética em um único comprimento de onda ou em uma faixa bastante limitada, conforme o filtro utilizado.

Ao se realizar uma análise por microscopia óptica utilizando objetivas de imersão, deve-se ter o cuidado de nunca permitir que a objetiva toque a lamínula, o que normalmente danifica a lente da objetiva.

Em microscopia óptica, um método eficiente que permite uma análise simplificada em duas etapas é aquele que realiza o ajuste do condensador seguido pelo ajuste do foco.

O método de Koehler, usado em microscopia óptica, é importante para se obter uma iluminação uniforme da amostra.

Em um microscópio como o apresentado no texto, podem ser formados quatro planos ópticos focais chamados de conjugados.

Se o microscópio mostrado na figura for do tipo invertido, as imagens observadas serão também invertidas, isto é, as regiões que transmitem mais luz serão vistas como estruturas mais escuras.

Caso seja usado o microscópio descrito no texto, com a objetiva de 40 vezes e as oculares de 20 vezes, as imagens das células serão aumentadas em 800 vezes.

Caso a célula de interesse seja uma bactéria, a identificação do complexo de Golgi é útil para a identificação de proteínas a serem secretadas.

Um dos primeiros pontos a se definir para a escolha de tecnologias é o tipo celular a ser analisado. Deve-se conhecer previamente se as células de interesse são eucarióticas, procarióticas ou acarióticas.

Quando há uma multiplexação dos canais de entrada de um sistema de aquisição de dados, ocorre a aquisição simultânea de todos os canais de aquisição.