O alaranjado de acridina é corante inespecífico, que pode se ligar tanto em DNA quanto em RNA, o que poderá deturpar uma análise do conteúdo de DNA por citometria de fluxo.

O uso de detergentes fracos, como a saponina, é recomendado para a marcação de moléculas intracelulares.

Cell sorting pode ser realizado por deflexão eletrostática ou divergência mecânica do fluxo. Nesse caso, além de obter-se um número maior de células totais selecionadas, a quantidade relativa de células de interesse (positivas reais) é maior.

Quando se deseja obter a maior quantidade possível de células de interesse cuja ocorrência em uma amostra é em geral reduzida, pode-se realizar o cell sorting no modo operacional de enriquecimento, enrich mode, nos citômetros nos quais essa opção esteja disponível.

A partir de uma amostra heterogênea de células, uma subpopulação pode ser selecionada por suas características físicas e(ou) fenotípicas, tais como granulosidade e expressão de marcadores de superfície.

Na medula óssea, as CTHs se encontram em um nicho, constituído em grande parte por células estromais que secretam uma matriz rica em moléculas de adesão e interleucinas, com finalidade única de prover suporte físico.

Na hematopoese, CTHs indiferenciadas podem dar origem a progenitoras comprometidas das linhagens linfoides ou mieloides, originando, neste caso, após ciclos de expansão e diferenciação, plaquetas, basófilos, eosinófilos, NK (natural killers) e macrófagos, entre outros.

Assumindo-se que parte da hematopoese fetal humana ocorre no fígado, do ponto de vista biológico, esse órgão poderia ser utilizado como fonte de CTHs, porém, há óbvios impedimentos éticos para tanto.

Todos os elementos figurados do sangue provêm de CTHs, que podem ser definidas funcionalmente, em humanos, pela presença do antígeno de superfície CD34, ausênica de CD38 e ausência de antígenos do tipo Lin (Lineage).

As CTHs destinadas a transplantes devem, obrigatoriamente, sofrer o processo de criopreservação antes de serem enxertadas em novo hospedeiro.