A TNE deverá somente ser instituída quando o paciente já estiver, de, pelo menos, 5 a 7 dias em jejum.

Síndrome do intestino curto, má absorção e diarreia são critérios de contraindicação para a TNE.

Para pacientes com elevado risco de aspiração, como aqueles com traumatismo craniano e disfagia grave, recomenda-se TNE por via nasogástrica.

São critérios avaliados para a indicação de nutrição enteral: trato gastrointestinal funcionante; ingestão via oral insuficiente; grau de desnutrição/catabolismo/percentual de perda de peso; presença de disfagia.

A localização da sonda em posição duodenal ou jejunal apresenta como vantagem a maior tolerância a fórmulas variadas (proteínas intactas, proteínas isoladas, aminoácidos), em relação à posição gástrica.