Embora incomum, o hipotireoidismo pode estar associado ao uso de amiodarona e seu aparecimento é chamado de efeito Jod-Basedow.

Pacientes com doença autoimune da tireoide subjacente estão em maior risco de hipertireoidismo induzido por amiodarona devido à falha em escapar do efeito Wolff-Chaikoff.

Na tireotoxicose induzida pela amiodarona do tipo II, o hipertireoidismo decorre da tireoidite destrutiva que resulta em liberação excessiva de T4 e T3, sem aumento da síntese hormonal

Nas áreas geográficas suficientes de iodo a principal alteração tireoidiana induzida pela amiodarona é a tireotoxicose do tipo III por liberação excessiva de T4 e T3.

Pacientes com bócio multinodular preexistente ou doença de Graves latente apresentam risco aumentado de tireotoxicose induzida por amiodarona do tipo I, uma vez que o excesso de iodo bloqueia a síntese do hormônio tireoidiano.