O PAA é executado através de Termos de Adesão firmados com Estados e Municípios ou através de repasse de recursos para execução pela Companhia Nacional de Abastecimento-Conab.

O Programa, com recursos do Ministério da Cidadania, pode ser executado em cinco modalidades distintas.

Agricultores familiares e suas organizações, que podem vender alimentos para o programa.

A periodicidade e os critérios de entrega dos alimentos são definidos pelos órgãos executores.

Cada modalidade possui regras de participação próprias e limites financeiros de participação específicos, que variam de R$ 6.500 por agricultor/ano até R$ 20.000,00 por agricultor/ano.