As zoonoses monitoradas por programas nacionais de vigilância e controle do Ministério da Saúde incluem doenças como peste, leptospirose, febre maculosa brasileira, hantavirose, doença de Chagas, febre amarela, chikungunya e febre do Nilo Ocidental.

As zoonoses de relevância regional ou local caracterizam-se por apresentar alto potencial de disseminação nacional, sendo monitoradas exclusivamente por programas nacionais do Ministério da Saúde.

Doenças como dengue e malária não podem integrar as atribuições da vigilância de zoonoses, pois acometem exclusivamente a espécie humana.

As zoonoses emergentes referem-se apenas a doenças erradicadas que reaparecem após curto período de ausência, sem impacto significativo na saúde pública.