A fase de latência do VEB caracteriza-se pela ausência total do genoma viral nas células hospedeiras, o que impede a reativação da infecção.

A infecção primária pelo VEB é geralmente sintomática e mais grave em crianças pequenas, apresentando-se frequentemente como mononucleose infecciosa.

Na fase aguda, há intensa resposta imune mediada por linfócitos T CD8+ atípicos no sangue periférico.

A infecção das células B pelo VEB é transitória e não resulta em diferenciação para células de memória, restringindo-se ao epitélio orofaríngeo.

A infecção primária pelo VEB ocorre na fase adulta, sendo rara a aquisição do vírus na infância ou adolescência.