A bacia ocupa 7,5% do território brasileiro, abrangendo seis estados, Bahia, Minas Gerais, Pernambuco, Alagoas, Serviços, Goiás, mais o Distrito Federal.

Sua região tem a maior abundância e variedade de peixes de água doce da região Nordeste.

Um destaque da Bacia do São Francisco é o Projeto de Integração do Rio São Francisco (PISF) com bacias hidrográficas do Nordeste Setentrional, que pretende captar água em dois pontos (eixo norte e eixo sul).

Possui formiável papel na geração de energia para a região Nordeste, com as usinas de usinas de Xingó, Paulo Afonso IV, Luiz Gonzaga e Sobradinho.

A principal demanda de uso da água da bacia é para irrigação (77%), seguida da demanda urbana (11%), demanda industrial (7%), demanda animal (4%) e demanda rural (1%).