A análise do comportamento desconsidera os processos cognitivos e afetivos na formulação de intervenções clínicas, uma vez que o foco da terapia comportamental está restrito às contingências de reforçamento e punição observáveis.

A terapia comportamental é voltada, exclusivamente, para a modificação de comportamentos disfuncionais, sem levar em conta os contextos sociais ou institucionais que influenciam o paciente.

A prática clínica que se baseia no comportamento leva em consideração os processos afetivos e cognitivos, mas os processos sociais e institucionais são vistos como irrelevantes para a compreensão e o tratamento de comportamentos problemáticos.

A terapia comportamental, quando integrada a outros modelos terapêuticos, considera a interação entre processos afetivos, cognitivos, sociais e institucionais, reconhecendo que os comportamentos humanos não ocorrem isoladamente, mas em contexto, com influências mútuas.

O foco exclusivo da terapia comportamental é no comportamento observável, e, portanto, os processos cognitivos e afetivos devem ser abordados separadamente, em intervenções que não envolvem a análise comportamental.