Alimentos de origem vegetal com presença de fungos filamentosos (bolores) na superfície não podem ser admitidos de nenhum modo, uma vez que alguns desses microrganismos são potenciais produtores de micotoxinas resistentes a temperaturas de até 250 °C.

As frutas e hortaliças para consumo in natura que estejam depreciadas para comercialização, isto é, que apresentem calibre, formato e coloração inadequados e pequenas injúrias mecânicas, não devem ser utilizadas para a agroindustrialização.

A obtenção higiênica do leite in natura na ordenha não exerce impacto direto na qualidade do leite processado, visto que o processo de pasteurização garante, por si só, a qualidade final do produto.

O desenvolvimento desordenado e acelerado de uma colônia de fungos alteradores de alimentos na matéria-prima de origem vegetal, ocasionado pelas temperaturas de estocagem acima de 35 °C em umidade relativa alta (maior que 90%), por mais de 24 horas, poderá ainda garantir produtos industrializados de boa qualidade, após o emprego dos métodos de conservação apropriados para essa matéria-prima.

O binômio tempo/temperatura da pasteurização do leite tem como principal objetivo reduzir a população microbiana patogênica e alteradora dos alimentos, evitando assim a transmissão de doenças, beneficiando também a tecnologia e a qualidade dos produtos de laticínios.