Um dos desafios que se impõe à prática psicológica no SUS é a consolidação dele próprio. Após anos de implantação, o SUS ainda sofre com problemas, como acesso, financiamento, descentralização, participação popular e oferta de serviços.

Há o desafio de formar profissionais de psicologia mais alinhados aos ideais e às demandas do SUS.

Identifica-se como desafio para a psicologia no SUS a reformulação da noção de indivíduo, transformando a prática privada dos psicólogos e sua identificação histórica com modelo médico-normativo.

Instituir a separação entre a saúde mental e a saúde pública, tratando-as como “universos paralelos”, constitui-se um desafio para prática psicológica no SUS.

Um dos desafios é compreender que toda política e toda ação de saúde devem ter como eixo a humanização.