Na função de auditor, o médico deverá identificar-se, de forma clara, em todos os seus atos, não sendo necessário o número de seu registro no Conselho Regional de Medicina.

Havendo identificação de indícios de irregularidades no atendimento do paciente, cuja comprovação necessite de análise do prontuário médico, é permitida a retirada de cópias exclusivamente para fins de instrução da auditoria.

O médico assistente deve ser antecipadamente cientificado quando da necessidade do exame do paciente, sendo obrigatório estar presente durante o exame.

O médico, na função de auditor, encontrando impropriedades ou irregularidades na prestação do serviço ao paciente, não deve comunicar o fato ao médico assistente.

Compete ao médico, na função de auditor, a aplicação de medidas punitivas ao médico assistente ou instituição de saúde, mencionando isso no seu relatório.