As duas fazem parte de um processo de avaliação realizado por órgãos superiores do sistema educacional, mas a interna avalia sistemas locais, enquanto as externas são realizadas somente para estabelecer comparativos entre nações.

Uma avaliação interna analisa os resultados dos sistemas educacionais municipais e estaduais, enquanto a externa analisa a educação de todo um país.

As avaliações internas são de iniciativa do governo federal, e a externa partem de entidades que analisam o desenvolvimento da educação em todo o mundo.

A avaliação interna é aquela realizada exclusivamente para entender o nível de conhecimento dos estudantes, enquanto que as externas avaliam a preparação dos professores.

A avaliação institucional interna pode ser entendida como uma autoavaliação, enquanto a externa parte de entidades superiores e analisa a instituição em um âmbito global.