No âmbito do Distrito Federal, a direção do SUS é exercida pelo Ministério da Saúde.

No âmbito dos Municípios, a direção do SUS é exercida pela respectiva Secretaria de Saúde ou órgão equivalente.

No âmbito dos Estados, a direção do SUS é exercida pela respectiva Secretaria de Saúde ou órgão equivalente.

No âmbito da União, a direção do SUS é exercida pelo Ministério da Saúde.