utiliza um par de iniciadores com baixa relação de complementariedade ao DNA-alvo.

se baseia na detecção da variação de mobilidade de uma enzima que pode ser igualada com alelos dos genes estruturais correspondentes.

as moléculas de DNA são submetidas a campos elétricos aplicados em duas direções alternadas, permitindo que as moléculas sejam reorientadas antes de ocorrer a migração.

o DNA é digerido com endonucleases de restrição, as quais geram fragmentos de tamanhos específicos.

a detecção do polimorfismo é feita com a hibridação dos fragmentos obtidos com uma sonda de RNAr.