A maior parte dos fármacos deixa o organismo pela urina, inalterados ou na forma de metabólitos polares.

Alguns fármacos são secretados na bile através do fígado, mas a maioria deles é reabsorvida no intestino.

A eliminação de fármacos pelos pulmões ocorre apenas em pacientes com desordens na função e na presença de doença pulmonares.

Alguns fármacos também são eliminados em pequenas quantidades em secreções com o leite ou o suor.