O aparelho branquial tem origem no mesoderma e é formado por arcos fendas e membranas branquiais e bolsas faríngeas.

As principais anomalias branquiais são os cistos, seios e as fístulas, sendo que estas podem ser completas ou incompletas, internas ou externas.

As anomalias do segundo arco são as mais raras e se apresentam na forma de cisto indolor na borda medial do músculo esternoclideomastóideo.

O cisto tireoglosso é a anomalia da linha média mais comum, a grande maioria é diagnosticada até os 10 anos de idade e o tratamento é sempre cirúrgico sendo contraindicado tratamento alternativos como esclerose ou radioterapia.

A ultrassonografia faz o diagnóstico em mais de 90% dos casos, sendo o exame complementar de escolha.