A Microscopia Confocal é ferramenta fundamental para a maioria dos estudos em Biologia Celular. Apesar do funcionamento do microscópio confocal ser semelhante ao do microscópio de fluorescência, existem algumas diferenças importantes em relação à constituição e funcionamento desses dois equipamentos. Por exemplo, no microscópio confocal, a fonte de luz iluminadora do sistema é proveniente do: