o auditor interno pertence aos quadros da entidade auditada, é subordinado ao alto escalão da gestão pública e possui maior grau de autonomia em comparação ao auditor externo independente.

a auditoria interna não pode ser exercida nas pessoas jurídicas de direito público interno ou externo.

a auditoria interna é realizada periodicamente e tem como interessado no trabalho a entidade auditada, e a auditoria externa é realizada de forma contínua e tem como interessado o público em geral.

o principal relatório da auditoria interna é o parecer e o da auditoria externa são as recomendações.

a auditoria interna busca promover melhorias nos controles operacionais, e a auditoria externa opina sobre as demonstrações financeiras de uma entidade.