A fase cefálica corresponde a fase que o alimento passa do esôfago para o estômago.

O estímulo visual ou olfativo e presença do alimento na boca resulta na ativação das regiões bulbares que enviam referências as glândulas salivares e promove estímulo de secreções e aumento da mobilidade, preparando o trato gastrointestinal para a chegada do alimento.

A fase encefálica corresponde ao estímulo no estômago para reduzir as taxas de esvaziamento, para que o quimo produzido fique retido no duodeno e receba as secreções intestinais e hepatopancreática.

A fase encefálica corresponde a contrações que ocorrem no intestino delgado para a movimentação do bolo alimentar pelo intestino grosso.

Nessa fase ocorre a secreção de gastrina, um hormônio proteico que atua sobre o estômago estimulando a atividade secretora.