Medicamentos sujeitos a controle especial e medicamentos termolábeis, pelo fato de requererem áreas específicas para armazenamento, devem ficar armazenados na Central de Abastecimento Farmacêutico, devendo a farmácia central fazer a solicitação apenas no momento da dispensação.

Itens volumosos e pesados devem ser dispostos sobre estrados ou pallets, encostados nas paredes e teto para evitar desabamentos, não ficando em contato direto com o solo para evitar acúmulo e penetração de umidade.

A adoção do sistema FIFO (do inglês first in, first out) – o primeiro que entra é o primeiro que sai – consiste na melhor estratégia para controlar a validade dos medicamentos armazenados na Central de Abastecimento Farmacêutico.

Medicamentos antineoplásicos podem ficar armazenados juntamente com os demais medicamentos, desde que esteja disponível um “kit” de derramamento e que todos os funcionários estejam devidamente treinados em casos de acidentes.

Durante o armazenamento dos medicamentos, podem ocorrer reações químicas de hidrólise, oxidorredução e fotólise que alteram a estrutura do fármaco afetando a sua estabilidade, sendo necessário o controle da temperatura, umidade e iluminação