Estudos imunogenéticos demonstram aumentada incidência de HLA-DR15 (em judeus ashkenazi) ou DRw8 (em outros grupos étnicos).

Pacientes com pênfigo vulgar têm anticorpos IgA patogênicos contra Dsg3, glicoproteína transmembrânica de 130kD, que compõem a laminina da membrana basal.

A lesão é caracterizada pela formação de bolha subepidérmica localizada na maioria dos casos, imediatamente abaixo da camada basal da epiderme (infra -basal), livre de células inflamatórias.

As lesões primárias são bolhas flácidas que surgem em pele normal ou eritematosa e que se rompem rapidamente, formando erosões dolorosas.