Antibióticos profiláticos sistêmicos são os mais indicados em pacientes que passaram por cirurgias limpas de baixo risco, sem contaminação bacteriana evidente.

Deve-se utilizar baixas doses de antibióticos para fins preventivos quando a incidência de infecção das feridas cirúrgicas é menor que 1% e a infecção não é grave.

O uso de antibióticos profiláticos sistêmicos para reduzir infecções se mostra muito benéfico em procedimentos de alto risco biliar, em pacientes acima dos 60 anos de idade.

Para suprimir bactérias intestinais aeróbicas e anaeróbicas, deve-se administrar neomicina e eritromicina uma semana antes do dia marcado para o procedimento cirúrgico.