Nas alterações classe I, a LDL não se liga corretamente ao LDLR na superfície da célula devido a um defeito no domínio de ligação do substrato ou no domínio que apresenta homologia estrutural ao Fator de Crescimento Epidérmico (EGF), presentes no LDLR.

Nas alterações classe V, o LDLR não é reciclado de volta para a superfície celular.

As alterações classe II afetam a região promotora ou a região codificante do gene, resultando em total ausência de síntese de LDLR ou na síntese de um receptor não funcional.

Nas alterações clase IV, ocorrem defeitos no processamento pós-tradução ou falha no transporte do retículo endoplasmático para o complexo de Golgi, ocasionando menor expressão na superfície celular.

Nas alterações classe III, o LDLR liga-se normalmente à LDL, porém não é internalizada eficientemente pelo mecanismo de endocitose via depressões revestidas com clatrina.