As rebeliões coloniais do século XVII, em especial a Guerra dos Mascates, foram influenciadas pelas ideias iluministas, notadamente as de John Locke.

Embora a historiografia tradicional localize as rebeliões coloniais a partir do século XVII, já no início da colonização colonial registram-se em São Vicente rebeliões contra os portugueses que intentavam trazer escravos africanos para o Brasil.

A primeira rebelião contra o domínio português foi a Conjuração Baiana, também conhecida como a Revolta dos Alfaiates, que proclamou a República da Bahia e deu início a um efêmero governo independente.

A criação das Companhias de Comércio, às quais o governo português concedeu o monopólio do comércio colonial, revoltou os colonos e em especial os comerciantes brasileiros que, no Maranhão, depuseram o governo local e expulsaram os jesuítas que contrariavam os seus interesses.

O choque de interesses entre os comerciantes reinóis e brasileiros ocorria principalmente na área fiscal. Enquanto os lusitanos eram isentos de impostos alfandegários, os brasileiros deviam recolher entre 20 a 80% do valor das mercadorias que exportavam e importavam da Inglaterra, da Espanha e de outros países europeus.