Segundo o Manual de Saneamento (Funasa – 2007), desinfetar a água significa eliminar os microrganismos patogênicos presentes nela. A água adequada para consumo humano, proveniente de poço, cacimba, fonte, carro-pipa, riacho, açude, etc., deve sofrer desinfecção, que pode ser feita antes ou depois do tratamento e, para isso, podem ser utilizadas diferentes substâncias químicas, dentre as quais a mais importante é: