É causada pelo protozoário Entamoeba histolytica.

A transmissão é pela ingestão de água e alimentos contaminados com cistos.

No intestino delgado, os cistos chegam na forma de trofozoítos.

Na amebíase intestinal, encontra-se a colite não disentérica, em que o paciente apresenta cólicas abdominais, períodos de diarreia, raramente com muco ou sangue, intercalados com períodos de acalmia.