O fígado e o músculo esquelético são os órgãos responsáveis pela regulação do catabolismo de aminoácidos indispensáveis, com exceção dos de cadeia ramificada (leucina e fenilalanina), oxidados somente no fígado.

Após a absorção intestinal, os aminoácidos são transportados primeiramente para o sistema linfático e na sequência, diretamente, para o fígado pelo sistema porta.

A velocidade de turnover (síntese e catabolismo) proteico é regulada pela quantidade de proteínas consumida, independente da função e do tipo de tecido ou órgão.

O grupo amino, proveniente do processo de desaminação, é liberado como ureia e excretado pelo fígado e pelos rins.

A maior parte da proteína do organismo é encontrada no músculo esquelético e em menor quantidade no pool de proteínas viscerais.