Este programa trata-se de uma política intersetorial entre os Ministérios da Saúde e da Educação.

A gestão do PSE é centrada em ações compartilhadas e corresponsáveis.

A articulação intersetorial das redes públicas de saúde, de educação e das demais redes sociais se dá por meio dos Grupos de Trabalho Intersetoriais (GTI).

O público alvo são crianças, adolescentes e jovens do ensino público e privado.

Educação para a saúde sexual e reprodutiva está entre as ações desenvolvidas neste programa.