Usualmente, o controle de temperatura de biorreatores encamisados é feito em cascata, para se obter maior precisão no controle, sendo a malha de temperatura do interior do tanque o controlador mestre e a temperatura da camisa o controlador escravo.

O controle de pH durante o cultivo é do tipo on-off, com as adições de álcali ou ácido sendo acionadas conforme o valor do pH do cultivo esteja fora da faixa da banda morta, onde o controlador não atua. A ação do controlador não pode ser Proporcional-Integral-Derivativa.

O conceito de banda morta para a malha de controle de oxigênio dissolvido é diferente do conceito para a malha de pH, pois no 1º, na banda morta, é mantida a ação do controlador quando o valor medido se encontra no interior da banda morta e no 2º, a ação do controlador é nula quando o valor medido se encontra no interior da faixa de banda morta do controlador.

O cálculo da demanda de oxigênio de um cultivo pode,em alguns casos, ser calculada a partir da leitura instantânea de oxigênio dissolvido.

O controle da concentração de oxigênio dissolvido pode ser feito em cascata com a vazão de ar e com a pressão.