O tipo mais comum é atresia com fístula distal para a traqueia (tipo C).

A associação com outras anomalias e síndromes sugere o envolvimento de diversas alterações gênicas e estudos recentes indicam que faça parte de uma neurocristopatia.

Quando a fístula distal for muito calibrosa pode haver grande fuga aérea, o que dificulta ou impossibilita a adequada ventilação pulmonar.

Quando a abordagem for transpleural, deve-se utilizar um dreno tubular mantido sob selo d’água.

Os maiores riscos observados após a abordagem cirúrgica são rejeição, atrofia e bacteremia.