A origem do mau hálito está localizada na cavidade oral em 50% dos casos.

O odor desagradável está, na maioria das vezes, relacionado à presença de compostos provenientes da ação de enzimas proteolíticas de bactérias Gram positivas aeróbicas presentes na cavidade oral.

As cáries são inerentemente malcheirosas, pois causam grandes espaços passíveis de acúmulo de alimentos.

A salivação deve ser observada, já que o fluxo salivar aumentado favorece a halitose.

A camada superficial da saburra está em constante contato com o ar formando uma camada anaeróbica. Já nas camadas profundas existem áreas com baixa concentração de oxigênio favorecendo a proliferação de bactérias aeróbicas.