Em caso de terceirização de análises de controle de qualidade, o contrato deve ser mutuamente acordado e controlado entre as partes, de modo a evitar equívocos na análise de qualidade. Serão emitidas três vias, sendo que uma delas deve permanecer no estabelecimento farmacêutico contratante, outra via será de direito do contratado e uma terceira via deve ser enviada à ANVISA, para que se estabeleçam claramente as atribuições de cada parte.

A água utilizada na manipulação de produtos é considerada matéria-prima produzida pela própria farmácia por purificação da água potável, devendo as instalações e reservatórios serem devidamente protegidos para evitar contaminação, assim como deverão ser realizados a cada seis meses, no mínimo, as análises de pH, Cloro Residual Livre e Presença de E. Coli.

As matérias-primas devem ser analisadas, no seu recebimento, efetuando-se no mínimo os testes de caracteres organolépticos, solubilidade, pH, peso, volume, ponto de fusão e densidade, tudo isso, respeitando-se as suas características físicas e mantendo-se os resultados por escrito.

As salas de manipulação devem ser mantidas com temperatura de 25 oC e umidade de, no máximo 65%. As respectivas condições de temperatura e umidade devem ser estabelecidas, monitoradas e registradas, diariamente.