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Tendo em vista que a bioinformática possui estreita relação com o
sistema operacional Linux, softwares livres e dependência de
hardwares específicos para viabilizar as análises, julgue os itens de
91 a 95, relativos ao desenvolvimento de software na
bioinformática.
O Linux, sistema operacional da família Unix, é amplamente
utilizado na bioinformática por ser livre e possuir uma
distribuição oficial centralizada.Provas
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Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese
revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA
ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso
pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos
organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea.
Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao
papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de
organismos.
A metagenômica estuda as comunidades microbianas
nos seus ambientes naturais. Técnicas de NGS são
utilizadas para sequenciar regiões do gene de rRNA 16S.
Computacionalmente, mesmo sequências que apresentem
diferenças de até 3% das bases podem ser consideradas
provenientes da mesma espécie.Provas
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Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese
revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA
ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso
pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos
organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea.
Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao
papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de
organismos.
Na análise de um alinhamento múltiplo de sequência de
parálogos de uma família proteica, a observação de pares de
resíduos (colunas do alinhamento) com frequência de
substituição correlacionada sugere que estes estabelecem
interações importantes para manutenção estrutural ou
funcional (sítio ativo) na proteína e, por isso, observa-se
a sua coevolução.Provas
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Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese
revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA
ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso
pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos
organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea.
Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao
papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de
organismos.
A construção de árvores filogenéticas, que se baseia em
sequências moleculares de proteínas ou de nucleotídeos, utiliza
metodologias como máxima verossimilhança, máxima
parcimônia e inferência bayesiana para fornecer representações
exatas da taxonomia de um grupo de organismos.Provas
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Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese
revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA
ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso
pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos
organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea.
Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao
papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de
organismos.
O uso de sequências moleculares para estudos evolutivos
requer como entrada um alinhamento múltiplo de sequências
gerado por programas como Clustalw e Muscle.Provas
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O prêmio Nobel de Química de 2013 foi concedido a cientistas
pioneiros da bioinformática estrutural, que desenvolveram modelos
computacionais para a simulação de dinâmica de proteínas. Acerca
da bioinformática estrutural, julgue os itens que se seguem.
Com os avanços da simulação computacional, foi solucionado
o problema da predição da estrutura tridimensional de
proteínas a partir de sua estrutura primária, eliminando-se a
lacuna, criada pela genômica, de milhões de sequências
disponíveis em bancos de dados sem informação estrutural.Provas
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O prêmio Nobel de Química de 2013 foi concedido a cientistas
pioneiros da bioinformática estrutural, que desenvolveram modelos
computacionais para a simulação de dinâmica de proteínas. Acerca
da bioinformática estrutural, julgue os itens que se seguem.
Na dinâmica molecular, aproximações baseadas em modelos
da física clássica são utilizadas para simular o movimento
coordenado dos átomos e, com isso, capturar as flutuações
conformacionais de moléculas, incluindo proteínas e ácidos
nucleicos.Provas
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O prêmio Nobel de Química de 2013 foi concedido a cientistas
pioneiros da bioinformática estrutural, que desenvolveram modelos
computacionais para a simulação de dinâmica de proteínas. Acerca
da bioinformática estrutural, julgue os itens que se seguem.
Programas de predição de estrutura que utilizam a modelagem
por homologia, dependem de proteínas que possuam estrutura
conhecida e identidade de sequência com a proteína predita.Provas
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O prêmio Nobel de Química de 2013 foi concedido a cientistas
pioneiros da bioinformática estrutural, que desenvolveram modelos
computacionais para a simulação de dinâmica de proteínas. Acerca
da bioinformática estrutural, julgue os itens que se seguem.
Bancos de dados como Pfam, SMART e CDD são importantes
para auxiliar na anotação funcional de proteínas, uma vez que
catalogam milhares de domínios proteicos, os quais são
segmentos discretos e conservados que adotam uma estrutura
tridimensional particular no contexto da proteína.Provas
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A partir da metade da primeira década do século XXI, com o
advento de novas tecnologias de sequenciamento de DNA
(tecnologias NGS), ocorreu uma revolução nas ciências genômicas.
A capacidade de geração de sequências foi incrementada, com a
consequente queda nos custos. No que se refere a essas tecnologias,
julgue os itens de 77 a 82.
O mapeamento genômico de sequências curtas oriundas de
tecnologias NGS contra um genoma de referência utiliza
algoritmos derivados do programa Blast, que faz uma busca
eficiente por similaridade entre um grande número de
sequências.Provas
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