Nas análises rotineiras de eletroforese bidimensional, após a ruptura dos tecidos e/ou das células, as proteínas são solubilizadas e desnaturadas em soluções contendo detergentes não iônicos ou zwiteriônicos, agentes caotrópicos e pequenas quantidades de agentes redutores, para posterior análise em gel. Assinale abaixo a única alternativa que não descreve exemplos, respectivamente, destas três classes de substâncias.

Interessado na produção de uma proteína com atividade antiHIV, você foi encarregado de produzir esta proteína em grande quantidade em um sistema acoplado a uma unidade de produção industrial. Visando selecionar um sistema que rendesse o melhor aproveitamento comercial possível, você realizou uma série de testes bioquímicos na proteína em questão e derminou as características e os parâmetros de interesse descritos a seguir.

I. Massa molecular da proteína 45kDa.

II. Ponto isoelétrico 6,8.

III. Proteína solúvel em metanol.

IV. Proteína com 35% de resíduos de carbohidratos.

V. Proteína ativa apenas na forma fosforilada.

Com base nos resultados, selecione, dentre as alternativas abaixo, a que contém o sistema de expressão mais indicado para a produção de sua proteína, em escala industrial, e com baixo risco de biossegurança, para seu posterior uso no tratamento anti-HIV.

Métodos químicos como o tratamentos com ácido trifluorometanossulfônico, hidrazinólize, β-eliminação e oxidação por periodados são exemplos de técnicas comumente utilizadas em análises proteômicas que pretender caracterizar proteínas que foram modificadas pós-raducionalmente por:

Analise as afirmativas abaixo com relação aos diferentes tipo de analisadores de massa.

I. Em um equipamento Q-TOF, um filtro de massa quádruplo está acoplado a uma analisador de tempo de vôo que diferencia as moléculas presentes em função do tempo de sua chegada ao detector.

II. Após a ionização por eletrospray, a relação massa/carga das moléculas é determinada por meio de sua trajetória em um campo elétrico estático ou dinâmico.

III. No sistema IonTrap, os íons são capturados em um campo onde eles podem ser acumulados e manipulados em análises subsequentes.

IV. No sistema Orbitrap, os íons circulam ao redor de um eletrodo central com formato fusiforme. A frequência de oscilações dos íons nesta trajetória é proporcional à raiz quadrada da razão m/z.

Assinale:

Interessado no estudo da proteína P954, identificada em um complexo de alto peso molecular existente em uma bactéria termófila recentemente isolada, você foi encarregado de desenvolver uma metodologia capaz de purificar a proteína em questão. Também era importante que sua metodologia pudesse identificar outras proteínas que façam parte do mesmo complexo da P954. Com base nos seus conhecimentos sobre química de proteínas e sobre métodos de purificação, assinale a alternativa que descreve a sequência mais parcimoniosa de etapas que possa levar a indentificação dos componentes deste complexo protéico.

I. Eletroforese bidimensional.

II. Análise de massa em aparelho Q-TOF.

III. Cromatografia de tamanho de exclusão.

IV. Purificação em gradiente de sacarose.

V. Co-imunoprecipitação entre proteínas.

É sabido que certos tipos de aminoácidos são facilitadores de certas estruturas secundárias, ao passo que outros, tendem a interromper ou desestabilizar outras estruturas. Assinale a alternativa abaixo onde são listados apenas aminoácidos quebradores de α-hélices.

São exemplos de reagentes rotineiramente empregados na purificação e análise de proteínas e que resultam, de forma independente, na separação de complexos protéicos:

Com relação ao sequenciamento de peptídeos acoplado à análise proteômica, assinale a alternativa incorreta,

A síntese de proteínas é um conjunto complexo de reações bioquímicas que garantem a produção de proteínas pela célula, a partir de um molde de RNA produzido a partir do genoma. Com relação à síntese de proteína, assinale a única afirmativa incorreta.

Com relação às técnicas de NMR e Cristalografia de raios X, assinale a alternativa correta.