Na montagem de novo de genomas completos, dois dos principais métodos utilizados são Overlap-Layout-Consensus (OLC) e grafos de Bruijn. Esses métodos diferem em sua abordagem para reconstruir a sequência do genoma.

A definição correta de grafos de Brujin é

A

dividir a sequência em k-mers e identificar caminhos Eulerianos para montar a sequência genômica.

B

alinhar todas as leituras de sequência entre si para encontrar sobreposições para gerar a sequência consenso.

C

produzir, a partir das leituras geradas durante o sequenciamento, sequências maiores denominadas contigs.

D

construir bibliotecas de clones de cosmídeos para facilitar a montagem do genoma.

E

realizar a clonagem de genes específicos em vetores de expressão para montagem de novo.

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3488820 Ano: 2024
Disciplina: Biologia
Banca: VUNESP
Orgão: UNICAMP

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Logo após a transformação bacteriana com o plasmídeo recombinante pGEM-T (mostrado na figura), a etapa subsequente que confirma a presença do inserto no processo de clonagem é:

Enunciado 4043315-1

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3488819 Ano: 2024
Disciplina: Biologia
Banca: VUNESP
Orgão: UNICAMP

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Assinale a alternativa correta que descreve a técnica mais comum para confirmar o tamanho de produtos de PCR.

A

Cromatografia de afinidade de alta resolução.

B

Cromatografia capilar bidimensional de alta resolução.

C

Citometria de fluxo utilizando anticorpos específicos.

D

Eletroforese em gel de agarose separa fragmentos de DNA com base na quantidade de bases púricas e pirimídicas.

E

Eletroforese em gel de agarose e presença de marcadores de peso molecular como referência para comparar e determinar o tamanho dos produtos.

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3488818 Ano: 2024
Disciplina: Biologia
Banca: VUNESP
Orgão: UNICAMP

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Para visualizar os produtos de PCR em gel de agarose, é comum utilizar

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3488817 Ano: 2024
Disciplina: Biologia
Banca: VUNESP
Orgão: UNICAMP

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O sequenciamento Illumina utiliza clusters de DNA gerados por

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3488816 Ano: 2024
Disciplina: Biologia
Banca: VUNESP
Orgão: UNICAMP

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O método Sanger de sequenciamento de DNA representa um marco fundamental na história da biologia molecular pelo cientista Frederick Sanger por sua habilidade de entender e manipular os processos bioquímicos que ocorrem durante a síntese de DNA. Tal desenvolvimento foi reconhecido como vencedor do Prêmio Nobel em 1980.

Sobre o princípio da técnica de Sanger, assinale a alternativa correta.

A

Cada didesoxinucleotídeo trifosfatado (ddNTP) utilizado na reação de sequenciamento de Sanger irá promover o término da reação de amplificação por interromper a formação da ligação fosfodiéster.

B

A reação de sequenciamento de Sanger é realizada pela DNA polimerase que requer uma fita de oligonucleotídeo iniciador (primer), na qual são adicionados desoxinucleotídeos trifosfatados (dNTP) ao grupo 5’ - hidroxila do primer.

C

Para que ocorra a reação de sequenciamento pelo método de Sanger são necessários desoxinucleotídeos trifosfatados (dNTPs), DNA polimerase, fita molde de DNA e um par de primers, sendo que cada primer reconhece uma das fitas de DNA que serão copiadas nas reações de amplificação de DNA.

D

O método de sequenciamento de Sanger requer a presença dos quatro desoxinucleotídeos trifosfatados (dNTPs), didesoxinucleotídeos trifosfatados (ddNTPs), além do par de primers, RNA polimerase e enzima transcriptase reversa.

E

No método de Sanger, a sequência de DNA é lida pela determinação de cores à medida que cada fluoróforo ligado aos desoxinucleotídeos trifosfatados (dNTPs) é reconhecido pelo detector que está acoplado a um sistema de computador.

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3488815 Ano: 2024
Disciplina: Biologia
Banca: VUNESP
Orgão: UNICAMP

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Considerando o esquema dos nucleotídeos de adenina representados a seguir, identifique quais são os nucleotídeos que poderiam ser utilizados no método de sequenciamento de Sanger, e a seguir, assinale a alternativa correta.

Enunciado 4043310-1

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3488814 Ano: 2024
Disciplina: Biologia
Banca: VUNESP
Orgão: UNICAMP

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Avalie as afirmações a seguir sobre técnicas de sequenciamento do DNA, e, a seguir, assinale a alternativa correta.

A

O sequenciamento de DNA de amostras biológicas obtidas de fósseis e restos arqueológicos é impreciso devido à degradação e contaminação do DNA ao longo do tempo, sendo impraticável pelo fato de gerar resultados não satisfatórios.

B

Atualmente o estado da arte sobre o tema sequenciamento de genomas inteiros ainda é um processo de baixo rendimento e pouco preciso, o que tem prejudicado estudos populacionais para explorar a diversidade genética.

C

A semelhança do genoma humano não permite que o sequenciamento de DNA de amostras de populações ancestrais forneça informações sobre a história humana.

D

O princípio da técnica do sequenciamento Sanger não contribuiu para o desenvolvimento de técnicas de sequenciamento de próxima geração (NGS), visto que se utilizam de princípios bastante distintos.

E

A descoberta da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) trouxe enormes benefícios para o desenvolvimento das técnicas de sequenciamento de genomas.