Na anotação genômica, é fundamental o estabelecimento de relações evolutivas e funcionais com espécies afins, e a busca por ortólogos é central para os esforços de transferência de anotação funcional, o que pode ser feito por meio de buscas em bancos de dados curados com grupos de genes ortólogos, como o KEGG.

A cromatografia de troca catiônica é um método utilizado para a purificação de proteínas que interagem com uma matriz carregada negativamente.

Em relação às técnicas “ômicas”, julgue os itens seguintes.

Estudos de genômica comparativa em plantas revelam que, dentro de uma espécie, enquanto os genes codificadores de proteínas são estritamente conservados, observa-se uma divergência evidente em termos de variantes estruturais nos genomas, fundamental para a determinação de características fenotípicas de interesse para a produção agrícola.

A cromatografia por exclusão molecular é usada para separar proteínas com base em sua solubilidade.

Em relação às técnicas “ômicas”, julgue os itens seguintes.

Entre as técnicas de redução de complexidade de genomas para diminuir custos de descoberta e genotipagem simultânea de milhares de marcadores genéticos estão a utilização de enzimas de restrição e seleção de fragmentos por tamanho (GBS e RADseq) e o RNA-seq.

Em relação às técnicas “ômicas”, julgue os itens seguintes.

A tecnologia Oxford Nanopore (kit R9.4) é a principal escolha nos programas de melhoramento assistido para genotipar marcadores genéticos do tipo SNP e microssatélites, por ser rápido, por não requerer amplificação por PCR e, principalmente, por poder amostrar milhares de bases em algumas leituras.

O CRISPR/Cas9 depende de uma endonuclease guiada por RNA, que cria quebras de fita simples no DNA, reparadas por recombinação homóloga ou união de extremidades não homólogas.

A transformação biobalística de plantas é uma técnica mais rápida e eficiente que a transformação mediada por Agrobacterium e permite a inserção de múltiplas cópias de material de genético com baixos custos.

A vantagem do Linux como sistema operacional de escolha para análises bioinformáticas é a disponibilidade de diversos programas executáveis via linha de comando em um terminal de texto. Em um arquivo FASTA (seq.fas) com milhões de sequências, pode-se contar o número único de sequências com o encadeamento dos seguintes comandos de shell BASH no terminal: 'grep ">" seq.fas | sort | uniq | wc -l'.

As técnicas de transformação genética de plantas podem ser classificadas em indireta, como a transferência de genes mediada por Agrobacterium para células-alvo, e direta, que inclui bombardeio de partículas/arma de genes, eletroporação e microinjeção.