Com os avanços no campo da biotecnologia, simulações de processos em escala de bancada são necessárias para a geração de parâmetros a serem adotados em operação de plantas de produção em grande escala.

Ciência e tecnologia devem ser introduzidas na agricultura familiar como apoio operacional para a modernização dos processos produtivos, respeitando-se a lógica de escala da pequena propriedade, e para a maior eficiência e eficácia das cadeias produtivas sem que toda a sociedade seja envolvida.

A introdução de sistemas integrados à Internet na agricultura familiar pouco contribui para o sistema produtivo, pois o custo de sua implementação é muito superior aos possíveis benefícios que possam gerar.

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue os seguintes itens.

Na área de genética e biologia molecular, com ênfase em bioinformática, a análise de dados em sistemas de informação biológicos e os bancos de dados biológicos são ferramentas de análise e comparação de genomas, probabilidade e estatística aplicada ao melhoramento animal e à experimentação agropecuária, não tendo, porém, eficácia na geração de marcadores moleculares.

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue os seguintes itens.

A utilização de uma busca heurística é uma alternativa à busca exaustiva, pois, nesta, se o número de características for muito grande, a busca será muito custosa computacionalmente, pois existem n subconjuntos para n características.

Os programas de alinhamento múltiplo de sequências, como o MUSCLE, CLUSTAL W e MAFFT, fazem uso da estratégia de alinhamento progressivo,em que uma árvore-guia é gerada a partir de todas as combinações de alinhamentos par-a-par, e, posteriormente, alinham-se as duas mais similares de acordo com a pontuação fornecida por uma matriz de substituição selecionável pelo usuário.

As matrizes de substituição são fundamentais para a realização de alinhamentos de sequências biológicas, e as variantes BLOSUM e PAM são o padrão em programas como o CLUSTAL W e BLAST, visto que elas modulam a taxa de substituição entre os aminoácidos e nucleotídeos que fornecem escores para as lacunas (gaps).

A expressão bacteriana, como a da Escherichia coli, é amplamente utilizada devido à alta capacidade das bactérias de realizar modificações pós-traducionais complexas.

O alinhamento de duas sequências biológicas é um exemplo clássico de utilização da programação dinâmica, especificamente para contemplar os diferentes tipos de alfabetos de caracteres no DNA e nas proteínas.

Na anotação genômica, é fundamental o estabelecimento de relações evolutivas e funcionais com espécies afins, e a busca por ortólogos é central para os esforços de transferência de anotação funcional, o que pode ser feito por meio de buscas em bancos de dados curados com grupos de genes ortólogos, como o KEGG.