O ciclo do nitrogênio pode sofrer desequilíbrio devido a práticas agrícolas, uma vez que o uso descontrolado de fertilizantes nitrogenados aumenta a concentração de íons amônio no solo. Esse desequilíbrio pode causar impactos ambientais, intensificando processos do ciclo que causam contaminação de águas subterrâneas e formação de gases de efeito estufa.

Esses processos são, respectivamente,