A eficiência da esterilização depende do preparo do material a ser esterilizado. Esse preparo segue os seguintes passos: descontaminação, pré-lavagem, enxágue, secagem e embalagem.

Após ter sido realizado todo o preparo do material e instrumental será feita a esterilização propriamente dita que pode ser feita por processos físicos e químicos.

A esterilização por processos físicos, realizada por calor seco em estufa, deve ter um tempo de esterilização contado a partir do momento em que o termômetro acessório atinge 260 ºC ou 270 ºC.

A esterilização por meio de calor seco tem a vantagem de não provocar corrosão de instrumental metálico e brocas de carbono, além de provocar menor perda de fio dos instrumentos.

A esterilização por processos químicos, também conhecido como processo de esterilização a frio, consiste na imersão total do material em solução de glutaraldeído a 2% por 10 horas. Essa solução tem efeito esporicida, virucida, bactericida e fungicida. Este processo de esterilização é de difícil operacionalização e requer cuidados especiais no manuseio e armazenagem dos instrumentos.