Na MMC, a protrusão da medula espinhal causa paralisia muscular abaixo do nível da lesão.

Embora ocorram disfunções musculares, os déficits sensoriais são menos comuns na MMC, uma vez que a sensibilidade é controlada pelas raízes dorsais, que não são acometidas.

Disfunções ortopédicas também ocorrem com frequência na MMC, sendo o desenvolvimento de desvios da coluna vertebral uma ocorrência comum devido à associação das fraquezas musculares à malformação dos corpos vertebrais.

Na MMC também é comum a ocorrência de disfunções urinárias e intestinais, já que são funções controladas pelos níveis medulares sacrais.