É indicado, mesmo que não haja risco elevado de infecção da ferida operatória, ou se não houver graves consequências se sobrevir esta infecção, e mesmo havendo qualquer objetivo de prevenir a ocorrência de infecção em outros sítios orgânicos no pós-operatório.

Ao se avaliar o risco da infecção bucal, deve-se utilizar drogas antimicrobianas de amplo espectro na profilaxia independentemente dos prováveis agentes causadores da infecção habitualmente conhecidos que fazem parte da microbiota endógena do sítio operado.

Ao se avaliar o risco da infecção bucal, deve-se levar em consideração fatores predisponentes ou favorecedores da infecção, tais como diabetes melito, obesidade, idade avançada, duração prolongada do ato cirúrgico, formação de espaços mortos, presença de tecido desvitalizado, coágulos e sangramentos, emprego de próteses, utilização de drenos e outros.

A profilaxia antibiótica é suficientemente importante independente do ambiente operatório podendo-se deixar de lado alguns cuidados na sala cirúrgica, como higienização do ambiente; redução do número de pessoas na sala; evitar a abertura da porta da sala durante o ato cirúrgico; utilização de roupas adequadas, entre outros.

Geralmente, o momento em que se dá a infecção cirúrgica situa-se nas 5 horas posteriores ao ato cirúrgico. Portanto, não existe comprovação da eficiência da ação profilática cirúrgica. Sendo assim, a administração da droga após a cirurgia é suficiente para o controle antimicrobiano.