A substituição das esterqueiras, utilizadas nos sistemas de confinamento de suínos para armazenar os dejetos para posterior uso como fertilizantes, por biodigestores pode aumentar a contribuição dos sistemas confinados no fluxo de emissões de gases de efeito estufa, dadas a retenção e a combustão do CH₄, o qual é convertido em CO₂ e energia.