A técnica de coloração simples, que utiliza apenas um corante, é o método mais eficaz para a diferenciação histoquímica de múltiplas organelas e tipos celulares em uma mesma amostra.

O protocolo de confecção de lâminas exige, invariavelmente, a fixação química prévia do espécime em formaldeído ou álcool, mesmo para observações rápidas de microrganismos vivos.

A aplicação de corantes vitais ou fixados possui caráter puramente estético, não interferindo no contraste ou na nitidez das estruturas subcelulares durante a análise microscópica.

As lâminas temporárias são montadas com meios líquidos (como água ou soro) e possuem durabilidade restrita, ao passo que as lâminas permanentes utilizam resinas de montagem que permitem o armazenamento e o estudo a longo prazo.

As lâminas permanentes, após passarem pelos processos de desidratação e diafanização, devem ser descartadas imediatamente após a primeira leitura para evitar a degradação do material biológico.