A fase faríngea é composta por ramos do hipoglosso e ramos do nervo faríngeo do nervo vago, que forma junto com o acessório, o plexo faríngeo.

Nesta fase, o nervo vago tem funções importantes, como a sensibilidade da supraglote, por meio de ramos do nervo laríngeo inferior, que também inerva a hipofaringe.

O nervo laríngeo recorrente, que inerva os músculos intrínsecos da laringe, exceto o cricotireóideo, está diretamente ligado à proteção e vias aéreas inferiores, relacionado ao fechamento glótico.

Os ramos do trigêmeo, do facial, do hipoglosso e do plexo cervical inervam a musculatura intrínseca da laringe.

Já o hipoglosso e o plexo cervical inervam os músculos extrínsecos da laringe – os músculos suprahióideos, que são responsáveis pelo retorno da laringe para a posição inicial antes da elevação e anteriorização.