A ação antimicrobiana da solução química auxiliar é a responsável pela desinfecção do sistema de canais radiculares em casos de polpa viva, enquanto, em dentes com necrose pulpar e em casos de retratamento, ela pode ser importante para evitar a contaminação dos canais radiculares.

Os principais objetivos do preparo químico-mecânico são: a limpeza, a ampliação e a modelagem do canal radicular principal.

A ampliação e a modelagem visam, por meio da instrumentação, à confecção de um canal de formato cilíndrico com o menor diâmetro apical e o maior em nível coronário.

Durante o preparo químico-mecânico, a limpeza é lograda, apenas, pela ação mecânica dos instrumentos endodôntico junto às paredes internas do canal radicular principal.