Nas análises de resíduos de disparo de armas de fogo, a MEV é mais recomendada do que a MO.

A MO revela mais informações relativas à natureza de amostras de fibras do que a MEV.

A análise de amostras padrão e questionada de vidro realizada por MO é mais recomendada do que a análise por MEV.

A MEV fornece informações sobre ranhuras e microvestígios em projéteis expelidos por armas de fogo que a MO não consegue fornecer. Dessa forma, os exames balísticos em projéteis devem ser necessariamente realizados por MEV.

As tintas podem ser facilmente analisadas por MO, técnica que fornece informações sobre a estrutura química dos componentes da tinta.