Por não apresentarem núcleo, todo o processo desde a transcrição até a síntese de proteínas, ocorre no citoplasma de procariontes.

.Genomas procariontes apresentam uma menor densidade de genes do que os de eucariontes.

Pela transferência de genes para o núcleo do hospedeiro, procariontes simbiontes intracelulares obrigatórios apresentam genomas menores do que os de vida livre.

Genes procariontes estão organizados em óperons característicos por apresentarem um único promotor para vários genes.

Com base em diferenças metabólicas profundas entre os grupos, os procariontes foram divididos em dois domínios, Archea e Bacteria, e os eucariontes agrupados no terceiro domínio Eukarya.